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没有化石也没关系。尼安德特人的DNA也可以从土壤中获得!

2023-03-13 大全 94 作者:考证青年

今天给大家介绍一下土壤的样本以及土壤调查的相应知识点。希望对你有帮助,也别忘了收藏这个站点。

没有化石也没关系。尼安德特人的DNA也可以从土壤中获得!

在过去的十年中,从人类遗骸中获取古代DNA的研究已经成为一项突出的研究,它使我们对人类和其他生物的进化史有了更深入的了解。除了人类遗骸,少数研究还从其他材料中获得了DNA,如牙结石、钙化结核和死海古卷(也就是死海古卷!),刮破古籍书页的橡皮擦屑,甚至口香糖,都有成功的案例。[1, 2, 3, 4, 5]

土壤里有古生物DNA吗?!土壤里有DNA吗?

最新发表的论文是从遗址的土壤中分离出DNA,拼凑出尼安德特人的基因组。除了感叹高超的新技术和充满希望的未来,这项研究还为尼安德特人的伟大历史带来了新的视角。[6, 7, 8]

从场地土壤中获取目标DNA

遗址里一定没有化石或者石器,但是一定有很多土壤。生物死亡后,DNA分解,散落在周围的土壤中。如果遗址地层中有化石,按理说DNA也有机会存活。

问题是土壤中可能会留下各种生物的DNA片段,非常难以分辨。土壤采样往往不是不可以,只是动物、植物、微生物中杂乱的DNA太多了。

在如此杂乱的样本中,你仍然可以只分离出你想要的特定DNA,但你必须先设定要抓谁,并设计出与目标序列互补的探针。

在西班牙 de las 的废墟中。挖!参考文献7

2017年发表的论文成功捕获了包括尼安德特人在内的多种动物的线粒体DNA,证实了从土壤中获取特定的DNA片段是可行的。2020年,论文获得了青藏高原夏河和白石崖洞穴不同地层丹尼索瓦人的线粒体DNA。[9, 10]

但是,线粒体和细胞核是两个独立的遗传单位,它们携带的信息有很大的不同。在人类中,线粒体中大约有16,500个碱基对,细胞核中有30亿条染色体。可想而知,即使能捕获线粒体的所有DNA,与核基因组相比也是微乎其微,捕获30亿个碱基对的难度完全是不同的维度。

幸运的是,尼安德特人和智人的基因差异是相似的。为方便起见,不需要捕获整个基因组,只需选择尼安德特人特有的DNA变异,针对那些部分。

基于这一想法,研究人员设计了探针来定位尼安德特人基因组上160万个可能的突变位置。如果土壤样本中的DNA片段匹配,它们将被捕获用于进一步分析。

遗址和样本的地理位置:和洞穴位于中亚,位于高加索,其余遗址位于欧洲。参考文献6

深入讨论的三个遗址,中亚的丹尼索瓦洞穴和西方的夏加尔的斯卡亚洞穴,都获得了高质量的尼安德特人基因组,适合比较。从两个地点获得的“妮妮”DNA的遗传变异与当地已知物种最接近,不出意外,也证明了新的采样分析方法是可行的。

西班牙的尼安德特人属于不同的基因群。

另一处遗址Galería de las (),位于西班牙东北部,可分为多个地层,距今7万年至11万年;出土了大约500件石器,都属于Most风格。这个地方本该是尼安德特人的家园,但只留下了一块脚趾骨折的化石。

西班牙 de las 遗址的地层和内容。参考文献6

根据新的泥浆技术,从这里的四个地层中成功分离出了尼安德特人的DNA,证实了他们在这里生活了很长时间。有趣的是:

早期和晚期尼安德特人属于不同的基因组。

如果按时间顺序只有两个样本,那一看肯定是连续关系。然而,到目前为止,古代DNA研究已经积累了18个尼安德特人(来自14个地点)、4个丹尼索瓦人和1个巴尼班丹人(都来自丹尼索瓦的一个洞穴)的基因组,以便我们可以更详细地比较他们的亲属。

西班牙 de las 遗址的早期和晚期尼安德特人属于不同的基因群。参考文献6

在遗址年龄更早的pit I Layer 4地层中,约11.2万年前的尼安德特人,以及德国的-和遗址(约12万年前),也有基因组最接近的尼安德特人(称为丹尼索瓦5号或 Andes,生活在900至13万年前的一段时间),他们的共同祖先可以追溯到13.5万年前。推断尼安德特人在此期间有一波扩张和分化。

遗址较晚的一号坑第三层距今约10.7万年,一号坑和二号坑第二层更晚。这三个地层中的尼安德特人基因组最接近7万年前高加索的 1和6万年前(或8万年前)中亚的 8。据估计,他们的共同祖先可以追溯到10.5万年前,当时可能已经发生了另一波扩张和分化。

然而,10.5万年前之后的尼安德特人,都起源于13.5万年前的一次分离浪潮。也就是说:

尼安德特人更早积累的大部分遗传多样性在11万年前丢失了。之后的尼安德特人,无论生活在哪里,都可以追溯到一个差异有限的分支。

根据基因组的差异,构建了尼安德特人之间的遗传关系。参考文献6

古人类学家早就注意到10万年前的尼安德特人差异相当有限,这可能与我们这次了解到的大灭绝有关。

除了遗传和形态,10万多年前世界各地尼安德特人发展起来的文化多样性(如克罗地亚的鹰骨饰品)也可能在这个瓶颈后受到重创。

穴居人每几万年就面临一次瓶颈考验?

如果把10多万年前西班牙尼安德特人的兴衰看作是一种“扩张-瓦解-扩张”的模式,那么非常有趣的是,这种模式可能不止一次上演。

根据线粒体DNA构建的系统发育树,生活在大约7万年前的尼安德特人似乎是一个独立的群体,可以追溯到更近的共同祖先。如果这些纹路可以代表每个时代不同地方的尼安德特人,那么上述情况反映了:

尼安德特人的遗传关系与年龄对比有关,而与地理位置无关。

同时期的尼安德特人,如4万至7万年前的尼安德特人,在基因上与这一时期的同龄人更接近,但与生活在同一地方的更年长的尼安德特人更疏远。

最明显的例子是,4.3万年前生活在高加索地区的尼安德特人与4.3万年前生活在比利时的同类更接近,但与7万年前生活在高加索地区的尼安德特人更疏远。

和之前一样,西班牙的尼安德特人与10万多年前高加索和中亚的尼安德特人接近,但与11.2万年前同一地方的同类相去甚远。

根据线粒体的差异,构建了尼安德特人之间的遗传关系。参考文献6

尼安德特人的膨胀和收缩似乎与环境的变化密切相关。比如十几万年前,有一个气候宜人的间冰期,有促进种族扩张的倾向。

然而,在5.7万年至7.1万年前的冰河时期,冻在寒冷中的尼安德特人遗址数量大幅减少,大部分分布在南方。每当尼安德特人经历类似的瓶颈阶段,他们可能会失去一些基因多样性。

回想起来,大约4万年前,尼安德特人面临最后一个瓶颈。西班牙在各民族逐渐消失的逆境下,成为尼安德特人最后的据点。以前的时代也是这样吗?然后尼安德特人就完全消失了。为什么他们这次不能再伟大一次?这些都是人类进化史上需要回答的重要问题。

土壤里的DNA会滋养出更多的进化树!

当然,这种膨胀收缩事件有很多因素,不仅仅与气候变化有关。另外,

虽然经过多年的奋斗积累了很多基因样本,但现有的数量和代表性还是相当有限,无法支撑任何确定的答案。以上说法目前只能算大胆推理。

乐观地说,在古代DNA测序技术成熟后,新的样本不断涌现。现在Nini技术的成功开发可能会大大增加基因组的范围和数量。可以预见,尼安德特人的进化树会越来越完整。

这只熊做不到!。新冠肺炎、熊本熊和日本暂停了与游客的直接接触。

除了探索人类进化史,新技术还可以用于其他生物。最近,一项研究从墨西哥的废墟中获得了美洲熊和灭绝的巨型短面熊(学名 simus)的部分基因组。[11]

延伸到其他生物只是时间问题。想起帕波曾经说过:

福尔摩斯缝了什么?

福尔摩斯在他的指甲里发现了一些奇怪的土壤样本。在要求警官移走尸体后,霍姆斯又取了一份血样。一丝不苟的侦探还在血迹的掩盖下找到了一把钥匙。

如何获取dnf土壤样品

土壤样本,过去 *** 地牢里的任务物品,不过是过去 *** 蚂蚁扔下来的。只有杀死蚂蚁才能得到土壤样本,左上方的房间会有蚂蚁。建议先刷完第四个房间和左边两个房间,再刷上面那个房间。

如何完成获取魔兽枯萎样本的任务

任务:从枯萎的巨人手中拿回斥候乌尔巴的报告,交给沼泽鼠哨兵祖莱。

任务地点:在赞加马彻的死亡泥潭中,巨人在略高的土壤样本处被击倒。

土壤的主要成分

土壤主要由石头和粗颗粒组成。一些土壤样本含有80%或更多的石头和沙粒。

以上是土壤样品和土壤调查的介绍。不知道你有没有从他们那里找到你需要的信息?如果你想了解更多这方面的内容,记得关注这个网站。

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